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中科院昆明動物所發布精準診斷一類疾病的核心使能技術

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摘要:近日,中國科學院昆明動物研究所馬占山團隊發布了兩項生物信息技術(算法和軟件)可用于精準診斷菌群相關疾病指標的研發,也可用于其它環境微生物群系監測的研究。相關研究分別發表在《微生物生態學》和《科學報告》上。現今,仍有一類疾病(例如乳腺炎、BV、IBD、肥胖、牙周炎等),由于對其發病機制缺乏完整了解,使臨床診斷存在諸多障礙。它們具有一些共同特征:就是與人體“菌群失調”密切關聯,類似于自然生

 

中科院昆明動物所發布精準診斷一類疾病的核心使能技術

近日,中國科學院昆明動物研究所馬占山團隊發布了兩項生物信息技術(算法和軟件)可用于精準診斷菌群相關疾病指標的研發,也可用于其它環境微生物群系監測的研究。相關研究分別發表在《微生物生態學》和《科學報告》上。

現今,仍有一類疾病(例如乳腺炎、BV、IBD、肥胖、牙周炎等),由于對其發病機制缺乏完整了解,使臨床診斷存在諸多障礙。它們具有一些共同特征:就是與人體“菌群失調”密切關聯,類似于自然生態系統(例如森林、湖泊)失衡可能會引發生態災害。

馬占山團隊定義了兩類生物信息標記(指標)算法。一類是菌群網絡中12種三角(基序)關系(trios),另一類是菌群網絡中正負比例。三角關系雖然簡單,但往往是決定系統格局和穩定性的重要因素。馬占山團隊定義的12種三角關系足以描述影響復雜網絡系統格局和穩定性的要素;而正負比例指標顯然受到了傳統中醫陰陽平衡思想的啟示。

馬占山團隊通過分析公共數據庫中已發表的菌群相關疾病的研究數據,示范了兩項生物信息診斷技術的有效性。當然,新診斷技術的適用性和有效性并非限于所檢驗過的這些疾病。馬占山團隊建立的原理、算法和軟件為用戶研發其它菌群(微生物群系)相關疾病的個性化精準診斷提供了全套分析和計算技術。目前,尚無其它類似能夠用于研發可靠、特異的菌群相關疾病診斷指標的通用技術(算法和軟件)。因此,新技術的發布為菌群相關疾病的精準診斷和其他環境微生物群系監測的研究提供了一項前景良好的核心使能技術。(生物谷Bioon.com)

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