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實習醫生日記之頑固失眠

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Nature:精準醫療需更精!轉移癌突變多于原發腫瘤

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摘要:月日在線發表在上的一項新研究發現平均來說轉移癌的遺傳突變比早期腫瘤要多這意味著要使精準醫療成為癌癥治療中的一個現實你需要一種實時全面的方法將轉移性腫瘤和序列置于比大多數商業測試更詳細的水平上美國密歇根大學綜合癌癥研究中心的研究人員對例轉移癌患者的和進行了測序這是研究晚期癌癥遺傳和分子景觀的最廣泛和最全面的努力之一有三件事使這種分析獨具特色
8月2日在線發表在Nature上的一項新研究發現,平均來說轉移癌的遺傳突變比早期腫瘤要多。
Nature:精準醫療需更精!轉移癌突變多于原發腫瘤
這意味著:要使精準醫療成為癌癥治療中的一個現實,你需要一種實時、全面的方法,將轉移性腫瘤和序列置于比大多數商業測試更詳細的水平上。
美國密歇根大學綜合癌癥研究中心的研究人員對500例轉移癌患者的DNA和RNA進行了測序,這是研究晚期癌癥遺傳和分子景觀的最廣泛和最全面的努力之一。
有三件事使這種分析獨具特色:
1. 研究人員對大多數病人進行了新鮮活檢,從轉移瘤中提取樣本,而不是原發腫瘤。
2. 他們對DNA和RNA都進行了測序。
3. 他們將癌組織與病人的正常DNA進行了比較。
通訊作者,密歇根轉化病理學中心主任Arul Chinnaiyan醫生說:“這是一種比大多數商業上可用的臨床測序程序更全面的方法。我們的研究結果表明,這個更詳細的方法有幾個層次上的價值。”
這些數據反映了密歇根腫瘤測序計劃中500位實體腫瘤患者的情況。這項研究始于2010,對轉移癌和正常組織的DNA和RNA進行測序,以確定對治療有幫助的改變。該計劃包括一個精準醫療腫瘤委員會,專家們會討論每一個病例。Mi-ONCOSEQ是第一個為癌癥患者提供的全面臨床測序項目。
在Nature發表的這篇文章中涉及的病人跨越了30多種癌癥,在22個不同器官有轉移。它只包括實體腫瘤的成年人,雖然Mi-ONCOSEQ也提供給血液癌癥患者和兒童。
對轉移進行活檢,而不是存檔的腫瘤
研究人員發現,轉移癌相比原發癌突變數量和類型顯著增加。他們發現幾乎每一種轉移癌都有更多的突變。這可能反映了轉移性癌癥更具攻擊性:它們有更多的時間來發展額外的突變,而旨在殺死癌癥的治療會導致更多的突變。
Chinnaiyan說:“我們的研究結果強調對轉移腫瘤獲得新鮮活檢的重要性,腫瘤在治療下進化成轉移的一部分。我們需要對轉移性腫瘤進行活檢,然后建議治療,而不是使用原發腫瘤的存檔組織。”
RNA測序揭示更多的靶標
另一個關鍵部分是即對DNA也對RNA進行測序。這種更廣泛的方法揭示了許多在腫瘤微環境中發揮作用的分子因素,這些分子因素促進并允許癌癥繼續生長、擴散或逃避治療。
一般來說,大多數臨床測序工作只專注于DNA測序。雖然DNA測序能夠揭示轉移癌的基因改變,研究人員發現RNA測序揭示了導致癌癥的基因,或關閉基因就能阻止癌癥的潛在機制。他們的發現有助于確定治療的潛在目標。
此外,通過研究RNA,研究人員可以檢測腫瘤微環境中的免疫細胞,這可以為免疫治療只對某些患者起作用提供線索。
Chinnaiyan說:“理解免疫微環境(浸潤腫瘤的細胞類型)及其表達是重要的。它給了我們一張關于免疫表型的圖。我們的假設是,我們可以用這個來幫助確定誰更容易對免疫治療起反應。”
另一個關鍵的發現是轉移性腫瘤表現為兩個相互排斥的特征之一。一種是高度增殖的,這意味著它成倍地增加。在另一個版本中,細胞失去了分化,稱為上皮間質轉化。
Chinnaiyan說:“不是所有的轉移都是一樣的。不同的途徑促使他們變得非常不同。這種相互排斥的方面是一個驚人的發現,可以指導我們開發新的治療方法。”
遺傳突變的發現
另一個引人注目的發現是,12%的轉移性癌癥患者有遺傳性突變。這大約是在所有癌癥患者中可能預期的四倍。這些突變是通過比較腫瘤DNA與正常DNA來鑒定的。
大約四分之三的這些突變與DNA修復的過程有關,有一些已經在現有的治療方法中被設計成靶標。
Chinnaiyan說:“在轉移癌中,遺傳突變的比例很高。一旦這些突變基因被鑒定,在患者家庭中別人也可能攜帶該基因,使其在癌癥的風險更高。”
如果適當的話,家庭成員可以尋求遺傳咨詢或額外的篩查。患者在Mi-ONCOSEQ接受的遺傳咨詢中,遺傳變異的案例也延伸到他們的家庭。
研究人員目前正在分析這個初始組的患者預后。今年早些時候在美國臨床腫瘤學會年會上提出的初步數據顯示,四分之三的腫瘤患者有一個“可操作的突變”,這意味著治療有針對性。到現在為止Mi-ONCOSEQ共有近2300例患者包含其中。(生物谷Bioon.com)
參考資料:Dan R. Robinson Yi-Mi Wu Arul M. Chinnaiyan,Integrative clinical genomics of metastatic cancer,Nature (2017) doi:10.1038/nature23306 溫馨提示:87%用戶都在生物谷APP上閱讀,掃描立刻下載! 天天精彩!
Nature:精準醫療需更精!轉移癌突變多于原發腫瘤
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