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實習醫生日記之頑固失眠

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PLoS Comput Biol:病人和HIV遺傳差異共同決定著HIV的感染進展

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摘要:根據一項新的研究在感染者之間觀察到的疾病進展率差異當中大約三分之一的差異是由遺傳差異和病人遺傳差異一起導致的
PLoS Comput Biol:病人和HIV遺傳差異共同決定著HIV的感染進展
2017年2月11日/生物谷BIOON/---根據一項新的研究,在HIV感染者之間觀察到的疾病進展率差異當中,大約三分之一的差異是由HIV遺傳差異和病人遺傳差異一起導致的。這些發現提示著病人遺傳差異通過觸發HIV病毒基因組發生突變而影響疾病進展。相關研究結果于2017年2月9日發表在PLoS Computational Biology期刊上,論文標題為“Estimating the Respective Contributions of Human and Viral Genetic Variation to HIV Control”。

HIV感染者經歷著不同的疾病進展率。在具有更高病毒載量的HIV感染者體內,HIV進展得更快。HIV病毒載量指的是在一名感染者的血液中發現的HIV病毒遺傳物質數量。

之前的研究已證實HIV感染者的遺傳差異和他們體內的特定HIV毒株遺傳差異共同影響著HIV病毒載量。如今,作為首批科學家,瑞士洛桑聯邦理工學院(école Polytechnique Fédérale de Lausanne)的István Bartha和同事們研究了病人遺傳差異和病毒遺傳差異對同一群HIV感染者血液中HIV病毒載量的相對影響。

這些研究人員收集了541名HIV感染者的病人遺傳數據和病毒遺傳數據。他們利用一種被稱作線性混合建模(linear mixed modeling)的計算建模方法確定病人遺傳差異和病毒遺傳差異如何可能解釋這些病人之間的病毒載量差異。

他們發現HIV病毒毒株之間的遺傳差異解釋了這些病人之間29%的病毒載量差異,而病人遺傳差異解釋了其中的8.4%的病毒載量差異。歸納在一起,這兩種遺傳差異剛好解釋了30%的病毒載量差異,這表明病人遺傳差異通過誘導HIV病毒在病人體內增殖時發生基因突變而發揮它的大多數影響。

論文通信作者Jacques Fellay說,“我們的論文證實病人和感染性病毒的遺傳組成導致HIV的臨床感染進展。”

為了證實和優化這些發現,還需針對更大的HIV感染病人群體進一步開展研究。

Fellay說,不論如何,“將宿主數據和病原體數據結合在一起讓我們對控制HIV的遺傳決定因子產生新的認識。一種類似的策略可能被用來更好地理解其他的慢性傳染病。”(生物谷 Bioon.com)

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原始出處:

István Bartha, Paul J. McLaren, Chanson Brumme et al. Estimating the Respective Contributions of Human and Viral Genetic Variation to HIV Control. PLoS Computational Biology, Published: February 9, 2017, doi:10.1371/journal.pcbi.1005339.

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PLoS Comput Biol:病人和HIV遺傳差異共同決定著HIV的感染進展
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