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我國建成全球第四個綜合基因組權威數據庫

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摘要:近日,中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊題為“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”(北京基因組研究所生命與健康大數據中心:從存儲到整合、再到轉化)的研究論文被國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發表。這是我國首次以數據中心為模式整體發布我國生命組

近日,中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊題為“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”(北京基因組研究所生命與健康大數據中心:從存儲到整合、再到轉化)的研究論文被國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發表。這是我國首次以數據中心為模式整體發布我國生命組學數據資源建設情況,標志著我國建設綜合性基因組數據資源獲得國際同行認可。

我國建成全球第四個綜合基因組權威數據庫

北京基因組研究所有關人員表示,此前,國際上被認可的生物組學數據中心主要有美國的NCBI、歐洲的EBI及日本的DDBJ,要想在國際期刊發表論文,需要先將自己的原始數據提交到這三個官方指定的數據庫中。“中國的生物組學數據產量約占全球的40%,是數據產出大國,卻沒有能夠被國際認可的數據庫系統,不得不將自己寶貴的數據資源交給他人代管。”

該數據庫成為國際上第四個被認可的生物組學數據庫。現在包括PNAS(美國國家科學院院刊)、Cell Research(細胞研究)等核心期刊在內的多個國際期刊已經認可把數據提交到BIGD。

北京基因組研究所生命與健康大數據中心(BIG Data Center)肩負建成面向國家大數據發展戰略的多層次生物組學數據資源系統的重要歷史使命。目前的數據資源系統包括高通量測序的原始組學數據歸檔庫GSA,圍繞國家重要戰略生物資源的基因組組數據庫GWH,基于測序數據的基因表達數據庫GEN,基于中國人群以及國家重要物種群體的基因組變異數據庫GVM,基于全基因組DNA甲基化圖譜的表觀基因組數據庫MethBank以及基于大眾審編的生命科學維基知識庫Science Wikis,初步形成了我國生命與健康數據匯交與共享平臺,具備可服務于全球的基因組數據共享網絡。(生物谷Bioon.com)

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